Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms