Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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ECM1Q16610 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ECM1Q16610 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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