Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
HERC1Q15751 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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