Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms