Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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