Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAX2Q9UIW0 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms