Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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