Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms