Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC048383.1-201ENST00000558226 527 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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