Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms