Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms