Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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