Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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TCOF1Q13428 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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