Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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