Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRHP20396 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 BBS12-201ENST00000314218 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRHP20396 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 COL28A1-201ENST00000399429 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRHP20396 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 SGK1-201ENST00000237305 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 JAKMIP2-202ENST00000333010 2992 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRHP20396 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms