Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
TRIM28Q13263 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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