Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCIRG1Q13488 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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