Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms