Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
GOPCQ9HD26 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms