Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAL4-202ENST00000406199 631 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HM13-IT1-201ENST00000421894 356 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT18P12-201ENST00000425245 1273 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7E110P-201ENST00000431186 574 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMX2P3-201ENST00000450122 957 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT42P-203ENST00000458343 671 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL294P-201ENST00000477271 295 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF7P1-201ENST00000478598 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS19P3-201ENST00000480487 441 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL681P-201ENST00000482763 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1-27-201ENST00000498435 382 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA76.1-201ENST00000516313 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 snoZ6.1-201ENST00000516391 75 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003057.1-201ENST00000526512 1245 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001972.4-201ENST00000530550 560 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPON1-AS1-201ENST00000534587 240 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPT1-215ENST00000546089 684 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITFG2-AS1-204ENST00000547834 411 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P32-201ENST00000566124 544 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AOC4P-204ENST00000569586 565 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT16P3-204ENST00000584759 681 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016590.1-203ENST00000590889 547 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OBP2A-207ENST00000619164 705 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC2L-215ENST00000625770 281 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO2A1-201ENST00000310926 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPECC1-204ENST00000395527 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG5-204ENST00000377732 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM4D-202ENST00000536741 2737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020978.10-201ENST00000623181 2704 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLK10-201ENST00000309958 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DCANP1-201ENST00000503143 3135 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK4-205ENST00000588540 3144 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-246ENST00000637309 7409 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCAL1-202ENST00000358207 3056 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2J3-215ENST00000511313 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRG3-201ENST00000370353 5977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms