Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ECM1Q16610 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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