Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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