Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN3Q13064 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN3Q13064 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN3Q13064 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN3Q13064 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
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MKRN3Q13064 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
MKRN3Q13064 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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