Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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