Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC93Q567U6 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms