Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SRSF5Q13243 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.3 ms