Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
DUSP1P28562 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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