Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF40O75150 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RNF40O75150 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RNF40O75150 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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