Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms