Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms