Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZDHHC9Q9Y397 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms