Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF5Q9Y2D1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF5Q9Y2D1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms