Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms