Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAK1Q9UPV9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms