Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SETD1BQ9UPS6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SETD1BQ9UPS6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms