Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms