Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms