Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms