Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms