Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms