Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms