Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms