Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms