Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms