Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms