Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP2BPQ9P2M1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP2BPQ9P2M1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms