Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP36Q9P275 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms