Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC88CQ9P219 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms