Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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