Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK12Q9NYV4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms